在医院手术室净化工程的实际应用中，医院医疗行业是一个非常庞大和特殊的行业，尤其对医院手术室的空气洁净度要求也很高。一般来说，合格的手术室净化工程或医用洁净室对医院空气的要求是采用百分之30效率的预过滤器和百分之90效率的次高质量的过滤器组合过滤的。一般情况下，不需要HEPA过滤器，但在特殊情况下，如隔离室、特定测试和护理区域。

  医院系统的洁净室比较早的应用于手术室，也就是我们现在所说的手术室净化工程。起初，由于手术时间长，容易引起感染，所以在骨科手术中才被广泛应用。理想的控制水平是利用手术台附近的空气洁净度达到100级。一般建议采用效率比较高的空气过滤系统，过滤面积至少为3M×3M，以包括手术台和人员。

  手术室净化是医院应用比较广泛的洁净环境。采用空气净化技术替代传统紫外线等手段，全过程控制污染的现代化手术室。在洁净手术室，可使患者感染率降低10倍以上，从而减少使用会损害患者免疫系统的抗生素。无尘、无菌是手术室净化的特点。